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管轄違いかもしれませんが、アニメです
原作が漫画かどうかは分かりません
すみません

15年以上前に父親のPCに保存されているのを見たので、放送はそれより前だと思います
PCには『マジカノ』というアニメも保存されていたので、それと同時期かも知れません
(マジカノは2006年の冬アニメ)

○覚えていること
・キャラクターは基本的に中高生位の女子達で、彼女たちは皆ロボットの操縦士
・舞台は沖縄とか九州とか、おそらく南の方
・主人公と友達とでサトウキビについてのやり取りがあって、俯瞰の画では海が近かった
・主人公は学園都市みたいな学校に転校してきたばかりの、元気な感じの女の子
・主人公は1話で初めてロボットに乗る。前もって決まっていたことではなかったみたいで、主人公は混乱していた
・ロボットに乗りながら管制室のようなところとやり取りをするが、コックピットでは主人公は裸だったようで、「こんな格好では外に出られない」みたいなことを言って、管制室の女性に「外からは見えないから大丈夫」と宥められていた

何と戦っていたのかは不明です
また、ロボットものではありますが荒廃した世界という感じではなく、緩い雰囲気でした