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一般的な雑誌の厚さだとするとガンガンではなさそうですかね。聖闘士星矢も年代的に合わない気がします。
ジャンルはバトル漫画でしょうか？
修行の一環とか過酷な環境に住んでいたとかふたりの状況がわかる情報や、キャラクターの名前の雰囲気（カタカナ、漢字）など、世界観が特定できるヒントがあると絞り込めそうだと思いました。

なんだかすごくいいシーンぽいので見つけたい…。

ピンポイントでそのシーンしか覚えてないので、数ページしか載ってなかったのではと思います。
月刊誌や、読み切りではなさそう？？

シーンの殆どがお兄ちゃんのモノローグだったので、名前や弟とのやり取りなんかはわからないです。

試練(修業？)として針山を歩いていたので多分バトル漫画だったとは思うのですが、ここはちょっと自信がないです。少なくともその回では戦って無いですし、スポーツ物では無いのは確かです。

服装がTシャツ(タンクトップ？)とズボンだったので現代ものだったと思います。異世界や中世とか、民族チックな物では無いですね。