地球の先住民族、デーモン族の存在を知ってしまった不動明と飛鳥了はデーモン族の侵略に対抗するために、悪魔と合体しようとするが…

悪魔アモンと合体した不動明は、ついにデビルマンとなった。デーモン族にとって危険な存在となった明の前に、強敵シレーヌが現れる！

食べた人間の顔が甲羅にうかびあがる残忍な悪魔、ジンメンが不動明に襲い掛かる！次々とやって来る悪魔たちに、人類の存亡をかけてデビルマンが立ち向かう。

ついにデーモン族が全人類に対して一斉攻撃を開始した。闘争本能に火がついた明は、了の制止をふりきり、たった一人でデーモン族に戦いを挑む！

人間の本性を知った不動明は、人類に守るべき価値を見出せなくなり苦悩する。唯一の守るべき存在の牧村美樹も、人間の手によって惨殺され、明はサタンとの最終戦争を決意する。