突如現れた巨大怪獣ロボット・タートルキングは、国際原子力センターを破壊し世界平和のために使われるはずだったウランを奪って逃げ去った！　この大問題に対応するため、国際科学技術機構の会議室に、各国の代表が集められた。その席上で、日本の南部博士は、怪獣ロボットを操っているのは「ギャラクター」であり、その脅威に立ち向かうには「少年科学忍者隊」の力を使うしか無い、と宣言する。少年科学忍者隊……ある時は五つ、ある時は一つ、実態を見せずに悪に忍び寄る白い影、その名も『科学忍者隊・ガッチャマン』!!

1860年3月3日江戸・桜田門外…薩摩藩士を含む水戸浪士17名が大老井伊直弼を暗殺。この暗殺が後に会津藩にとって悲劇の始まりになろうとは誰一人考えもしなかったであろう…。――会津藩士七百石・井上丘隅(六十才)無役ながら、子供たちに論語・会津の歴史を教え、その人柄に重役から農民まで誰もが慕っていた。そしてその中には後に飯盛山で壮烈な最期を遂げる…白虎隊二番隊の少年たちがいた…。白虎隊の壮絶な生き様を描いた作品！