異世界に召喚された二堂仁は、世界でただひとりの魔法工学師(マギクラフト・マイスター)の 後継者に指名された。与えられた魔法技術と現代知識で、仁はモノ作りで異世界の人々を幸せにしようと奮闘する。
となり村に向かっていたジンたちを正体不明のゴーレムが襲ってきた。ジンは工学魔法でゴーレムをなんとか倒したが、犯人まではわからなかった。しかしジンはその場でゴーレムを改造し、村のために役立てようとする。
クライン王国の理不尽な貴族のせいで、ジンはカイナ村から研究所のある島へ帰還した。しかし島の食糧事情により、ほかの町へ遠征することに。そこでジンは、魔法工作士(マギクラフトマン)の女の子と出会う。
ポップコーンが話題となり、貴族の屋敷に招待されたビーナ。しかし、その技術力を手に入れようとしたガラナ伯爵にビーナは襲われてしまう。ジンとビーナの考えに賛同するクズマ伯爵は救出に向かうが……。
ポトロックにやってきたジンは、造船工のマルシアとともにゴーレム艇競技に参加することに。優勝を目指すジンとマルシアだが、何者かの手による妨害工作を受けながら、レース当日を迎える。
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