「ガンダムUC」の世界で、ジオン残党軍とのＭＳＶ大バトル！　そこへユニコーン３号機《フェネクス》、さらにダークセシアの機体も次々と参戦し……。離ればなれのレオスとセシアが衝撃の再会を果たす、「ＥＸＡ」新シリーズ第２巻！

レオスは愛機type-レオス２ ヴァリアント・サーフェイスを完成させるため、自称・宇宙一のメカニック、ロウ・ギュールのもとを訪れていた。そんな中、ＧＡデータ全ての破壊を目論むアル・アダはダークセシアと自らの軍に、レオスとの戦いを命じて…。アル・アダ軍VSレオス軍の大バトルが始まる！！

ついにアル・アダ軍との全面対決を迎えたレオスたち。アル・アダのスプレマシーギアを相手に、レオスは完成したヴァリアント・サーフェイスで立ち向かう！　その戦いの最中、思わぬ巨大MAが乱入し……！！　愛する２人が何故！？　レオスＶＳセシア開幕！

ジュピターXのＧダイバー、レオス・アロイはセシア・アウェアのナビゲートにより、様々なガンダム世界へとダイブしてゆく。その中で、レオスは「人類進化の鍵は戦闘にある」と理解する。一方、マーズ１のアル・アダは地球と決別し、外宇宙に旅立つことで「人類進化」を為そうとする計画ーーエクソダスアンサーを進めていた。互いに「人類進化」を目指しつつも、激突せざるを得なかったレオスとアル・アダ。セシアも巻き込んだ戦いの末に、レオスとセシアは新たに「人類進化の鍵」を探して行動するのだった。そんな中、トリムは「人類進化同盟」を結成し、レオスの前に立ちはだかる…！新機体、新戦艦、新勢力ーー新「EXA」第５巻!!「機動戦士ガンダム エクストリームバーサス マキシブースト ON」との極限コラボ進行中！！

トリムの甘言に乗らず、彼との戦いを選んだレオスとセシア。２人は、「人類進化」にとって必要なセシアの肉体をトリムから取り戻そうとするが、行く手を阻む「コメット」らの姿が……。２対２の激闘が始まる！