10年後に襲い来る『魔物大氾濫』での人類滅亡を回避するべく江副和彦はくノ一・朱音と共に、自宅庭のダンジョン攻略を開始。時を同じくして、世界中で次々とダンジョンが出現し始める。死傷者も現れ、各国政府は無視することはできず対策を急いでいた。さらなる被害の拡大を防ぐため、江副はダンジョン攻略に特化した専門企業の設立を決意。資金に算段をつけ、仲間集めに奔走――　「ダンジョン・バスターズには意志の強い仲間が欲しい。自分のためだけでなく、他人のために戦える仲間だ……」　しかし、新たな仲間の候補として現れたはずの魔術師エミリは、生意気な態度で江副と反りが合わないかに思われたが――!?　世界の命運を背負った男のダンジョン攻略譚、第二幕！

江副和彦は『株式会社ダンジョン・バスターズ』を立ち上げ、人類滅亡の危機から世界を救うべく、動き始める。仲間集めはエミリに続き、何かと世話を焼いてくれる少女・茉莉と彼女の“相棒”ことウサギの魔物・ミューも加えて順調に進み、政府も『ダンジョン冒険者制度』を設立し対策を急ぎ進めていた。さらに江副は正式な“冒険者”の資格と新たな仲間を得るため試験に挑み、世界チャンピオンの宍戸彰と意気投合、同志となる！　「お金や名誉に興味がない！人間より強い存在と熱い戦いがしたいんだ!!」　一方、市民に危機感はなかったが遂に被害者まで出てしまい――　世界の危機に身を捧げる男のダンジョン攻略譚、第三幕！