江副和彦は、経営コンサルタントを生業とし独身を謳歌していた。だが突如、彼の自宅の庭にダンジョン――『深淵』が出現し一変! 興味本位で足を踏み入れたことで「ダンジョン・システム」が起動し、江副の下僕を名乗る謎のくノ一・朱音まで現れ、衝撃の事実を告げる。「今後、世界中に全666のダンジョンが出現し、10年以内に全てを攻略できなければ…… 『魔物大氾濫』により人類は滅亡します」 さらに、その事実を知るのはシステムを起動した江副ただ一人。図らずも招いてしまった世界の危機を救うため、彼がまず始めたのはダンジョンの検証と改良―― “ダンジョンDIY”で……。東京の片隅から人類の未来を守るダンジョン攻略譚、開幕!
10年後に襲い来る『魔物大氾濫』での人類滅亡を回避するべく江副和彦はくノ一・朱音と共に、自宅庭のダンジョン攻略を開始。時を同じくして、世界中で次々とダンジョンが出現し始める。死傷者も現れ、各国政府は無視することはできず対策を急いでいた。さらなる被害の拡大を防ぐため、江副はダンジョン攻略に特化した専門企業の設立を決意。資金に算段をつけ、仲間集めに奔走―― 「ダンジョン・バスターズには意志の強い仲間が欲しい。自分のためだけでなく、他人のために戦える仲間だ……」 しかし、新たな仲間の候補として現れたはずの魔術師エミリは、生意気な態度で江副と反りが合わないかに思われたが――!? 世界の命運を背負った男のダンジョン攻略譚、第二幕!