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“ＳＳ”――それは高度な特殊技能を有する機動隊員のみに与えられる特別な称号。主人公の高良風馬（たから・ふうま）巡査は、アクロバティックな忍者スポーツ「パルクール」を得意とする新人機動隊員。ＳＳに憧れているが、具体的にどうすれば受章できるのか分からない。訓練に明け暮れていたある日のこと、ドローンを扱う班の新人女性隊員・碓氷凛子（うすい・りんこ）がＳＳ候補だという噂を聞きつけて……。「パルクール」で市民の命を救う――新感覚ポリスアクション!!

かつて栄華を誇った日本の忍者たちは、戦後GHQによって組織を解体させられ消滅した。しかし、実は今でも忍者は秘密裏に存在しており、その数は20万人とも言われている。そして一部の精鋭忍者は国家レベルの争いごとの裏で暗躍していた。一方で、末端の忍者は仕事にありつけないことも多く、その一人・雲隠九郎もニート同然の暮らしをしていた。しかし、そんな九郎のもとについに重大な「忍務」が‥‥！