とあるじじばばから縁を切り、海洋生物として生きる事を決めたナギサはその途中、潜水艦“双鯨”にはねられ連れて行かれてしまう。目を覚ました彼女は記憶を失っており、思い出した名前は「サシミ」。ナギサの事を知っている、小山内とナギサを探しに来た妹のツナミはなんとかして、ナギサの記憶を取り戻そうとするが、そこに海賊が現れ…。