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12宝石が司る仮想空間で、ダンスと出会いに満ちた旅がはじまる――。ウイルスによってBOX内に閉じこめられてしまったこころたちのもとに、「現実（リアル）輸送プロジェクト」というメールが届いた！もとの世界へもどるため開いた扉の先に待っていたのは、紫色に輝くお城がそびえる「2月（アメジスト）エリア」だった!!こころは無事に現実世界へ帰れるの――!?

「わたし、みんなを助けたい！」仮想現実の世界・BOXで2月（アメジスト）を治める英雄（ブリリアント）・双子のベル＆ベラとのダンスバトルに勝利したこころ。しかし、ウイルスで暴走したベルにより、ひとりBOXから現実（リアル）へもどされてしまう。みんなを助けるため、BOXにもどる手がかりを求めるこころがたどりついたのは……!?

現実から戻り、みんなを探して5月エリアを目指すこころ。だけど、その前に立ちはだかる9月英雄・イヴ。そして、また新たな英雄が――!?現実から5月エリア、そして新たなエリアへと仮想現実での少女の旅はつながっていく！新世代・魔法少女の宝石ファンタジー、ついに佳境へ!!