15歳以上の男女に半年間の“特殊訓練”を課す新たな義務教育。揺篭島でその訓練を受けていたカヅキたちだったが、ある日、眠りから覚めると島は完全な廃墟と化していた。何が起こったのか困惑するカヅキたちを待ち受けていたのは、剥き出しの狂気と、それを見つめる謎の管理者たちだった…。

“特殊訓練”のために15歳以上の男女を集めた揺篭島。ある日、眠りから覚めると島は完全な廃墟と化していた。圧倒的に不足している情報と、生き延びるための手段を求め、それぞれの秩序が大きく狂い始めていく中、全体をまとめてきたトウジが凄絶な最期を迎える…。

トウジの死後、ばらばらになった７月生を急襲する４月生たち。結晶化したトウジを指し示し、ミキヤは訓練生に施された残酷な「改造」の真実を語る。それは治癒能力を極限まで高めたことの恐るべき副作用だった。一方、ひとり不可解な暴力行動を続けるキョーヤの前に立ちはだかるサイ。死闘の末、追い詰められたサイは、ひとつの決断を下す……。