日本国の平和と安全を他国の侵略から防衛する秘密特捜隊、コマンド。ある時、日本にあるS国のスパイ組織の拡張と、革命を起こそうとする謀略のために二人の外国人が来日した！コマンドでの中で最も優秀な男・Jは、S国スパイ団の行動を封じこめんとするが…？世界の悪人相手に、Jが数々の秘密兵器で立ち向かう！