あらすじ“23細胞”によって誕生した突然変異体との激闘が決着――。23の行方を追って倉田製薬生体研究所に忍び込んでいた史樹は、そこで遂に23と再会を果たす。平和な日常を取り戻した史樹と美伽は喜び合うが、倉田製薬で人間の闇を垣間見た23の心には困惑が広がっていた。そんなある日、N県で村民45人が惨殺される事件が発生する。唯一の生存者として全裸の少年が無傷で保護されるが……。