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クラスメイトと共に転移してきた高月マコトは“魔法使い見習い”としてハードモードの異世界ライフをスタート。成り行きで女神ノアの唯一の信者となってしまい、彼女が囚われる最難関のダンジョン攻略に挑むことに――。修行の道中、残念すぎる炎の魔法使いルーシーらと出会いクエストに挑むも、強力な魔物グリフォンが現れ大ピンチ！　しかもノアから彼女たちを見捨て逃げるよう指示されるが……　「女神様、俺は仲間を見捨てません」　チートに恵まれなかったからこそ身に付けたマコトの非常識な戦い方が逆転の一手となる!!　最弱の少年が大物食いに挑む異世界攻略ファンタジー第二幕!!

邪神と判明した女神ノアの唯一の信者である高月マコト。低能スキル持ちと蔑まれながらも、魔法使いルーシーと共に、グリフォンを倒すなど、着実に冒険者としての名を上げていた。やがて“良い出会いがある”というノアの神託を受けたマコトは、親友のふじやんたちと『大迷宮ラビュリントス』に挑む！　しかし、突如ドラゴンに襲われ、迷宮深く落ちた先は格上の魔物たちが牙を剥く、まさにデッドライン――　「これが『ゲームオーバー』ってやつか」　そんな絶体絶命の状況下、神託にあった“出会い”がマコトたちに訪れ……!?　最弱の少年が難関迷宮に挑む、異世界攻略ファンタジー第三幕!!

仲間と共に難関迷宮に挑んでいた高月マコトは、ドラゴンの襲撃を受け、迷宮の中層に落ちてしまう。そこで、「蛇女」という魔物に転生していたクラスメイト・佐々木アヤと奇跡の再会を果たす。さらに、アヤが経験した悲劇――異世界で出会った家族を無残にも惨殺されてしまったことを知ったマコトは、“敵討ちをしたい”と切なる想いを告げる彼女に対し……　「手伝うよ、大切な友人だから」　心優しき友の願いを叶えるため、仲間の力を結集し、マコトは全身全霊で強敵に立ち向かう！　最弱の少年がボスキャラに挑む異世界攻略ファンタジー第四幕!!

高月マコトは、再会した佐々木アヤの敵討ちを助け、見事ハーピーの女王を討ち果たすのだった。さらに、同じダンジョン内で『忌まわしき竜』に苦戦していた光の勇者・桜井たちと共闘し、討伐に成功。激戦を無事に戦い抜いたマコトは、その戦いぶりから『大賢者』と呼ばれる魔法使いに気に入られてしまう。“話がしたい”と大賢者に招かれ、相見えると――　「お前…邪神ノアの使徒か――」　『邪神の信者』という秘密が早々に見透かされ、ノアに関する衝撃の事実を告げられるのだが……。最弱の少年が女神の謎と真実に迫る異世界攻略ファンタジー第五幕！

正式に邪神ノアの使徒となった高月マコトは、大迷宮での冒険を終え、水の街マッカレンに帰還。その活躍を受け、招待された王都でかつて彼のことを不要と切り捨てたソフィア王女との再会を果たす。形式上は歓待は受けるものの騎士に絡まれたり王都での冷遇は相変わらずだったが、偶然にマコトの魔法を見た王女の弟・レオナード王子からは何故か懐かれ、城の食事会に誘われると――　「僕の…先生になってくれませんか!?」　その申し出に対し、ソフィア王女は難色を示す中、王都が魔物の襲撃を受けたという報告が入り……!?　最弱の少年が王都の危機に立ち向かう　異世界攻略ファンタジー第六幕！