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壮絶な過去を抱えながら、懸命に今を生きるリサイクルショップ店員･加瀬宗助（かせ・そうすけ）。彼がようやく手に入れた、小さな幸せは、突如出現した、巨鳥･サンダーバードによって奪われた。恩師･駿河（するが）を鳥に殺されながら、どうにか生き残った加瀬は、駿河の愛娘･マリを守りながら巨鳥と戦うことを決意する。