第506統合戦闘航空団「ノーブルウィッチーズ」は、欧州貴族が集まるA部隊と、リベリアンのB部隊で構成され、互いに軋轢を抱えていた。そんな中、A部隊に編入された元気印の黒田那佳が両部隊の架け橋に――!?
基地内で突然起こった爆発事件。ケガを負った那佳が病床に伏す中、事件の調査にやってきたキーラから“身内の破壊工作”の可能性があると聞かされ、互いに疑心暗鬼に陥ったウィッチたちだが、その真相は一体――!?
キーラとともに忽然と姿を消したジェニファーを追って、那佳とカーラはガリア中を大捜索する! 果たして那佳たちはジェニファーを取り戻せるのか!? 異色の部隊の物語、コミック版完結!