20世紀末、謎の伝染病に侵された国・日本は、他国により列島ごと封印され、鎖国状態になった。それから千年――世界中で人々の混血化が進み、明らかな人種の特徴が現れにくくなった中で、黒い髪・瞳を持つ幻の純血人種日本人は、世界の天然記念物として珍重され保護されている……。密猟者に捕まり闇の競売にかけられていた桜は、グレアムに助けられ、日本へ。「ガイジンだけは信じちゃいけない」――そう言い聞かされていた桜だったが、グレアムの優しさに惹かれ始め…。