東の海にある小さな島、トニートニー島。この島の平和を守っている、正義のヒーローがいた。その名も、チョッパーマン。そして、側にはサポート役のナミフィア。新たな最強アドベンチャーが開幕するぞっ!!
平和なトニートニー島に、怪人・怪獣を送りこむ悪の権化・Dr.ウソダバダ。ゾロキラーを仲間に加え、サポートのナミフィアと共に島を守る、正義のヒーロー・チョッパーマン。しかし、新たな強敵が現れ…!?
チョッパーマンの優秀で可憐なお手伝いナミフィアが悪の権化・Dr.ウソダバダにさらわれた。ゾロキラーとサンジロプスと共に、ウソダバ団悪の基地まで救出に向かう。1階の強敵を倒したが、2階の敵は…!?
最強の敵を打ち破り、ウソダバ団を見事壊滅させたチョッパーマン。お花怪人ロビフラワンとも友達になり、トニートニー島に無事戻った。だが、ウソダバ団の研究所が見つかり、そこには危険物が残されて…!?
復活した悪の権化Dr.ウソダバダ。そして、恐るべき音楽の能力を持つブラック・ブルック。『クロスパワー』を求めて、トニートニー島へやって来た悪者たち。果たして、チョッパーマンたちの運命は…!?感動の最終巻!!