立て続けの災難に遭った神守凛(かみもりりん)の前に20年前に別れたきりの透也(とおや)が現れる。彼に連れられて、なぜか神本家の巫女の代替わりの儀式に参加することに! 忌み神と人間の婚姻譚開幕!
透也そっくりのマガツヒの神の巫女に選ばれた凛。神を疑う神守一族に神威を見せつけた神は力尽きてしまう。成り行きで神の世話をすることになった凛だったが、その姿に昔の透也との思い出を重ねる…。
失せ人を言い当て、神からの信託を得る巫女としての力を見せた凛。しかし神から透也の死を告げられた凛はショックを受ける。凛を溺愛する神だが、凛はどうしても透也のことが忘れられず苦悩する…。
神守一族の一人が不審死? 祟りを疑われた神だったが凛の強い願いを聞き入れ、死者を蘇らせる。その力に平服する神守一族だったが、彼らは神と凛を利用することしか考えていなかった…。
マガツヒの神の中に透也の魂もいることを知った凛は神と共にいることを受け入れる。しかし透也の義弟・継太郎から衝撃の過去を伝えられる。「兄は生贄にされた。マガツヒに食われた」
衝撃の過去に同様を隠せない凛。しかし継太郎が言ったことは虚言だった。マガツヒの神と共に神守家との因縁を断ち切ろうとする凛。忌み神と人間の婚姻譚ついにクライマックス!