若き会社経営者・佐凌恒生は、亡き恋人・藤野沙雪と瓜二つの「少女ペット」を飼い始める。一方、恒生が沙雪を死に追いやった張本人だと信じる沙雪の弟・蒼太は、恒生への復讐のために「少女ペット」を入手する…。

「魔術犯罪者は頭のネジが飛んでいる…魔術狩りは頭のネジが壊れてる」　王立魔術学園きっての神童“元素統率者”アリス=フォートゥナーは世に跋扈する魔術犯罪者を裁くべく、魔術狩りを目指していた。そんな彼女が出会ったのは一人の冴えない旅の魔術師、シン＝レイスロード。しかし、彼の本性はーー。

なんの変哲もない男・モブ男の前に現れた死亡フラグちゃんこと「死神No.269」。実はモブ男がいるのは失敗続きのフラグちゃんを見かねた神様が彼女の練習用に用意した仮想世界。だが、フラグちゃんは心優しいため、一度もモブ男のフラグの回収に成功できずにいた。それでも彼女を温かく応援する神様やドSだけど実は優しくなりたい生存フラグさん、イタズラ大好きの恋愛フラグがフラグちゃんの周囲に集ってきて、事態はいつも思いがけない方向に。はたしてフラグちゃんは、立派な死神になることができるのか!?　そしてモブ男は生き残ることができるのか――!?