魑魅魍魎の住まう「幽世」。人間が住まう「現世」。そして、地の底「虚世」……。虚世とは現世から流れ出る「穢」の掃き溜め。昔々、幽世の国に「御霊神樹」という神樹がありそれは、虚世への入り口を護る役目を担っていた。ある時、大病を患い、大量の穢が幽世に溢れてしまった。庇護ノ神はそれを酷く嘆き命を　して虚世への入り口を塞いだのだが穢は「鬼生種」として現世へ撒き散らされたのであった。鬼生種を御霊神樹に戻すためとある漢方医の旅が始まる――。