肉体は未成熟ながら、ぷりち一＆せくしーな小学４年生・七瀬加利奈ちゃん（10）。その従兄（いとこ）で頭脳明晰、クールな魅力の生徒会長・塚本浩一くん（12）。学園を舞台に、この麗しくも妖しい禁断のカップルが荒んだ心を癒し、斬ります。

ある日、近づくマラソン大会に向けて『マラソンカード』が配られた。このカードとは、休み時間や放課後に校庭を走り、１周ごとにマスを埋めていくというものなのだが、そんなことはおかまいなしに昼休みにドッジボールをはじめる加利奈たち。それを見ていた６年の学年主任・国吉政子(くによしまさこ)は、マラソンをさせようと叱るのだが……。

４年３組にやってきた教育実習生の原田良介(はらだりょうすけ)は、担任の水木先生が『例外』という加利奈と打ち解けるために積極的に話しかけるのだが、なかなかうまくいかない。ほかの教師から話を聞いた原田は、問題児のことを理解しようとしない教師側にこそ問題があると考え、なにかと加利奈に接するように努めていくのだったが……。