改めて読みたいと思った作品なのですが、タイトルが思い出せず、キーワードで検索してもヒットしないので困っています。

1、物語冒頭で主人公(年齢は高校生以上。敵側のボスの親友のクローン)は脳だけの状態で路地裏に捨てられている。
2、それを発見した天才博士が主人公を持って帰り、少女の肉体(博士がかつて一緒に暮らしていた少女をモデルに、死体を継ぎ合わせて作製した)に主人公の脳を移植。主人公は少女として復活する。
3、博士と主人公の生活が始まる。敵側から攻撃された時に、主人公が覚醒。口から糸を吐いて繭になったあと、蝶モチーフの怪人のような姿に変身して戦う。
4、猫の獣人みたいなキャラが主人公たちのペット的ポジションにいる。
5、最終話で博士は消失するが、その博士を探しにいく主人公というエンディング。

どなたか心当たりがありましたら、教えていただけると幸いです。

ネットでちょっと探してみたんですが夏目さとるさんの『人造少女』というマンガじゃないでしょうか。
Twitterで作品名を検索すると、結構話題にしてる人がいるので、もっと詳しい情報が分かるかも。

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話題に出たマンガ一覧

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ペット リマスター・エディション

ペット リマスター・エディション

『ぶっせん』『イムリ』と常に話題作を送り出し、唯一無二の個性を発揮し続ける鬼才・三宅乱丈の代表作、大きな話題を呼んだサイキック・ロマン巨篇が、全編にわたる徹底的な加筆修正と150ページ以上の描き下ろしクライマックスを加えた「完全リマスター・エディション」が、ここに新生!数々の話題作を手がけるジェノスタジオによって、アニメ化が決定!!監督を務める大森貴弘氏が10年以上、映像化を切望していた本作。シリーズ構成は『夏目友人帳』で大森氏とタッグを組んだ、村井さだゆき氏。 【イントロダクション】人の脳内に潜り込み、記憶を操る能力を持つ者達がいた。彼らのその力は、事件の揉み消しや暗殺など、裏の世界で利用されてきた。人の精神を壊すほどのその力は、同時に彼ら自身の心を蝕んだ。彼らはお互いを鎖で縛り付け合うように、脆く危うい心を守った。彼らは恐れと蔑みからpet(ペット)と呼ばれた。