天才科学者、如月博士の娘として作られた、スーパーアンドロイド、キューティーハニー!女ばかりの犯罪結社「パンサークロー」がハニーを狙って動きだした!
ハニーの体内に取り付けられた、あらゆる物質を作り出す、空中元素固定装置を狙って、「パンサークロー」の刺客が次々に襲いかかる!ハニーは如月博士の仇を討てるのか!?
キューティーハニーと「パンサークロー」との壮絶な戦いから三十数年・・・一度は倒されたかに見えたシスタージルが再びハニーにせまる!
「パンサークロー」の地球壊滅計画がついに動きだした!異次元空間へと乗り込んだハニーたちは、シスタージルの野望を止めることができるのか!?