亜由は架地くんに片思い中のフツーの女の子。そこへ自分の事を魔女だという「フツー」じゃない女の子・仁菜が出現。そして亜由と仁菜の不思議な毎日が始まった……。
架地くんが手作りクッキーをゴミ箱に捨てる所を目撃した仁菜。これがモテ男の正体だが、彼を好きな友達の亜由に伝えてもいいのやら?ときめき不思議ダイアリー。
亜由は憧れの人・架地くんと両想いになり念願の初デート。一方、2人の恋を応援している魔女っ子仁菜は、クラスメイトの辻合くんに正体がバレそうになり……。
人前で魔法を使った仁菜は、ユタに抱きしめられながら怒られてしまった。運悪く、その現場をユタの彼女・紗也香に見られてしまい…。ときめき不思議ダイアリー。
紗也香のじゃまが入ったけど、魔女っ子仁菜と辻合くんは無事カップルに。でも幸せ気分も束の間で、魔法王国から仁菜の迎えが突然現れて…!?ついに感動の完結編!!