古からの都……京都……その生物は隕石に乗ってやって来て、人間の魂を喰らうために平安の人々を襲った。その生物を人々は畏れこう呼んだ。「平安京影裏暗」。……甦った異形たちを薙ぎ払い滅するために、千年の時を超えた現代、けっして人に知られる事もなく戦い続ける宿命の巫女たち……陸上自衛隊特務部隊・陰陽寮「焔」所属検非違使、榊夕子。朧かすみ。……祓之刃「白刃不知火」が一閃する!
陰陽寮「焔」所属・弓崎桜……同・弓崎橘……私たちにはわかる……カラスに殺された人達の魂が吸い上げられていく……あの敵は、その存在を受け入れ、認識した者にのみ、その目に映る。敵の名は……「平安京影裏暗」。奴の字名は【鴉】。その名の通り、無数の烏を操る……
聞いてくれ、榊……君が好きだ。私も……後でお前に話がある……電光の侍、二人の思いを刃に……影裏暗との戦いは最終章に……