ゲーム好きの高校生・三神シゲルは、幼なじみの忍原いつきに気にかけられながらも平穏な学生生活を送っていた。――そう、その日、彼が見知らぬ一本のゲームソフトに導かれるように、とある美少女と出会うまでは……。
デスゲーム『NOTALIVE』に巻き込まれた三神。アバターである鏡花との連携も増し、彼女も徐々に心を開いてきて……
ついに始まったバトルロイヤル戦!だが、「生き残る」という勝利条件の中、プレイヤーたちの間で疑心暗鬼が起こり……
バトルロイヤル戦の勝利条件は生き残ること。次々と脱落者が出ていく中、謎の黒髪美少女アバター・有馬と手を組み、制限時間まで生き残ったと思われた三神たちだったが、ゲームはまだ終わっていない様子で……。三神たちはこのゲームの謎を解くことができるのか!?そして、“NOTALIVE”について何か知っているらしい有馬の正体とは――!?
プレイヤー第3位“旋律”のMAZE戦、開幕!!水中戦、肉弾戦、スキルを使っての戦略、すべてにおいて今までの敵とは異質の圧倒的強さを持つMAZE。三神たちはMAZEを相手に防戦一方になる中、彼女の強さの理由を知り……。
ブラック・トレードに拉致された三神と鏡花。だが、突然始まったイベント戦に巻き込まれ……。
2回目のイベント戦――それは時間制限内であれば、他のアバターに触れることで、相手のプレイヤーとアバターを入れ替わることができるというもの。そんな中、唯一のゲームクリアプレイヤーであるアスタロトが姿を現し……!?
ついに始まったラストバトル! 三神たちは参加者の一組である“皇帝紳士”撃破に向け、行動を開始する。しかし、三神たちの攻撃が届かぬ位置から放たれる敵の攻撃に次第に追い詰められてしまう。その危機から三神たちを助けたのは、意外な人物で……!?
今までの戦闘で一度もダメージを負ったことがないという“鉄壁”のストラトス。敵に姿を見せず、気づかれぬうちに攻撃をしかけ、敵を仕留める。そんな彼女の戦い方に三神たちは防戦一方で……。三神たちはこの“鉄壁”を打ち破ることができるのか!?
いつの間にか荷物に紛れ込んでいたディスク。それに触れた瞬間、三神シゲルは見知らぬ少女の中にいた。少女の名前は天宮鏡花。それが彼女との出会いだった。それから二人は共に戦い、多くの時間を共にしてきた。しかし、鏡花に関する重大な事実が明らかとなり……。ミステリアスな少女とのボーイ・ミーツ・ガールストーリー、終幕。