男らしさを求める小学五年生・彰はいつもライバルの忠士と張り合っている。しかし、どうしても柔道だけは忠士に敵わなかった。そんなある日、遺跡調査をしていた父が強い男になれるというアヤシイ薬を持ち帰る。強くなりたいという一心で彰は隠れてその薬に手を出したが…!?
半人前の火忍・タケシが仲間達と共に修行を終えた日、月影の宝刀・銀鱗刀と金鱗刀が奪われてしまう。そして、タケシ達も謎の忍者による襲撃を受け、その中心に盗まれた宝刀を持つ葛城一族の末裔・冬馬の存在を知る。時を越え、因縁の月影流と葛城流の戦いが今始まる…!
幼い頃に母を亡くし、ずっと父と二人で暮らしてきたミカ。親が離婚して母の元で暮らしていたマチ子。二人は同級生だが、その二人の親が再婚する事になり突然家族になる事になった。少女たちの複雑な心の中を描いたストーリー。