マザーシステムに統制された近未来――。平和な学園生活を送っていた少女たちに、ある日突然異変が！鉄機核を埋め込まれたシオンたちは、戦いの渦中へと投げ出される。失われた昨日までの日常、続くは滅亡への明日。少女たちは重い宿命を背負うことに……!?人類を操る謎の少女の目的は!?グランジに変容した少女たちの運命は!?