とある町の祓い師・栖神家に生まれた少年・京一には、6つ違いの美しい姉・華壱がいた。祓い師としての力が強い華壱は、京一のために彼女が相対した妖怪の弱点などを記した「カイダンにっき」を作ることが日課だった。そんな華壱が6年前のある日を境に行方不明となる。姉が消えた原因が自分にあることを自覚する京一は、華壱を取り戻すため、彼女の友達と称する死神のクロエと協力しながら「カイダンにっき」の完成を目指すことになる―――。
人魚が出るといううわさの海岸にやってきた京一たちオカルト研究部と死神・クロエ。調査もそっちのけでビーチを楽しむメンバーたちだが、京一とクロエの仲は次第に険悪になり……。
明らかになった死神クロエの正体。そして、神隠しにあい消えてしまう京一。まゆみは異世界の攻略法を手に、京一を取り戻すために電車へと飛び乗る。だが、そこで待っていた者は……。