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世界を支配しようと企む海賊を倒すため、訓練生のエースたちが派遣された。ジェイクたちも負けじと海賊船に潜入し、船の中&海の上で大バトル！ロボットや仲間と協力し、果たしてジェイクたちは世界を救うことができるのか!?

ジェイクたちが初級訓練生としてXロボットアカデミーでの授業や試験に励んでいる中、学園にとつぜん、ナゾの恐竜ロボットが現れた！どうやら恐竜好きの友達アンディが不満を抱えて恐竜ロボットを作り出してしまったらしい。学園や友達を守るために、ジェイクたちは最強の恐竜ロボットを倒すことができるのか!?

みんなが寝静まる真夜中。Xロボットアカデミーに巨大なゾンビロボットが現れた！ゾンビロボットは攻撃してもダメージを受けないが、ストーンがプログラムを無事修正できれば倒せるらしい...!?友達を信じて、Xベンチャー調査隊や教官、上級訓練生が力を合わせて命がけのバトルをくり広げる！