機械いじりが得意な高校生・タヅナは、修理依頼を受けて大学の研究室を訪れる。そこで出会ったのは、ベッドで眠る一人の少女・コヨリだった。何かに導かれるようにコヨリの指先に触れたタヅナ。するとどこからか声が降り注ぎ、目の前に異質な世界“ジグラート”が現れる。それは“ハンドシェイカー”として目覚めた２人の、「願い」をかけた戦いの始まりだった――。