親友のナラを捜すため、安全な集落を出て、危険な森へと冒険に出た小人のシイタ。森で、シイタの父親の命を狙う謎の男・イズナと出会い、生き抜く術を知り尽くした彼と旅をともにすることになった。イズナと協力し、狂暴な「イタチ」を退治すると、その先で見たこともないほど大きな「足跡」を見つける。この足跡の持ち主とナラの行方は関係しているのか…謎は深まるばかり。手掛かりを探る道の途中で、クーゲルと名乗る少女に「集落を助けてほしい」と懇願され、向かうと、そこには大量の「アリ」に襲われた集落・バーンがあった。果たしてシイタたちはアリを一掃することができるのか、そしてナラの手掛かり見つかるのか…!?